Vrchol Velkého Javoru vykazuje v průměru 160 mrazivých dnů a dobu sněhové pokrývky 150 dnů. Z důvodu pozdních a brzkých mrazů trvá vegetační období sotva déle než 100 dnů. Teplota v červenci se v oblastech hřebene pohybuje kolem 11 stupňů. Z ročních srážek zhruba 1950 mm spadne 40% jako sníh.